MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT9547

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017212	GGA	2	6	17	22	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017212	A	6	6	3886	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017212	T	7	7	3904	3910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017212	T	6	6	3939	3944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017212	TAAA	2	8	3959	3966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017212	CAT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017212	T	10	10	4021	4030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017212	TCC	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017212	ATT	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017212	ATT	2	6	4888	4893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017212	TTCAAA	2	12	4929	4940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017212	A	6	6	4958	4963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017212	TTA	2	6	4975	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017212	AAT	2	6	4985	4990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017212	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017212	A	6	6	5191	5196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017212	TA	3	6	5291	5296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017212	GAGAGT	2	12	5297	5308	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017212	CTA	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017212	TTA	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017212	ATTAAA	2	12	5411	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017212	A	7	7	5420	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017212	CTT	3	9	5936	5944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017212	CTTTT	2	10	5973	5982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017212	TTA	2	6	6100	6105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017212	AATT	2	8	6118	6125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017212	TAAT	2	8	6141	6148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017212	A	7	7	6160	6166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017212	T	7	7	6218	6224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017212	TCAT	2	8	6285	6292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017212	A	7	7	6302	6308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017212	T	7	7	6366	6372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017212	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017212	TGA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017212	CAT	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017212	CTTT	2	8	6601	6608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017212	ATT	2	6	6657	6662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017212	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017212	A	7	7	6761	6767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017212	AAC	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017212	TATT	2	8	6846	6853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017212	AATT	2	8	6880	6887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017212	ACA	2	6	6928	6933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017212	TTA	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017212	TA	3	6	6983	6988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017212	AT	3	6	7013	7018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017212	A	7	7	7036	7042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017212	T	6	6	7067	7072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017212	A	6	6	7158	7163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017212	CA	3	6	7176	7181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017212	TTAG	2	8	7217	7224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017212	TGA	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017212	ACT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017212	GA	3	6	8656	8661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017212	TCT	2	6	9015	9020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017212	TCAT	2	8	9050	9057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017212	ATTA	2	8	9087	9094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017212	A	6	6	9094	9099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017212	T	6	6	9168	9173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017212	TAT	2	6	9182	9187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017212	T	6	6	9208	9213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017212	T	7	7	9249	9255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017212	T	6	6	9298	9303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017212	ATA	2	6	9322	9327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017212	AT	3	6	9401	9406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017212	TGT	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017212	TAA	2	6	9481	9486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017212	ATAA	2	8	9524	9531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.